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植物原位杂交在遗传育种方面的应用主要包括:
异源染色质及多种染色体畸变检测:通过远缘杂交把有用遗传物质基因的异源染色质渐渗到植物中。如带有几种抗病基因的黑麦1R染色体已被整合到许多高产的小麦品种中。原位杂交技术则是鉴定外源染色体(质)的有效手段。
基因组印记研究:基因组印记是指一个基因的两条染色体上的DNA序列存在差异。通过植物原位杂交技术,可以检测到基因组印记的存在和分布,荧光原位杂交,从而帮助确定基因组的进化、遗传和功能特征。
FISH技术的基本步骤包括探针制备、样品预处理、探针与样品的杂交、信号检测和图像分析等。在探针制备过程中,使用荧光标记物代替同位素标记物来标记探针。在样品预处理过程中,细胞或组织的固定、裂解和去除非特异性蛋白质等操作都是必要的,以提高探针与目标序列的亲和力和特异性。在探针与样品的杂交过程中,探针与样品中的目标序列进行互补性杂交,形成可检测的荧光信号。在信号检测和图像分析过程中,使用高灵敏度荧光显微镜检测荧光信号并获取高分辨率的细胞图像。以菌落原位杂交为例:对分散在若干个琼脂平板上的少数菌落(100-200)进行筛选时,可采用该方法。将这些菌落归并到一个琼脂主平板以及已置于第二个琼脂平板表面的一张纤维素滤膜上。经培养一段时间后,对菌落进行原位裂解。主平板应贮存于4℃直至得到筛选结果。
将少数菌落转移到纤维素滤膜上
(1) 在含有选择性的琼脂平板上放一张纤维素滤膜。
(2) 用无菌牙签将各个菌落先转移至滤膜上,再转移至含有选择性但未放滤膜的琼脂主平板上。应按一定的格子进行划线接种(或打点)。每菌落应分别划线于两个平板的相同位置上。后,在滤膜和主平板上同时划一个含有非重组质粒的菌落。
(3) 倒置平板,于37℃培养至划线的细菌菌落生长到0.5-1.0mm的宽度。
(4) 用已装防水黑色绘图墨水的针头穿透滤膜直至琼脂,在3个以上的不对称位置作标记。在主平板大致相同的位置上也作上标记。
(5) 用Parafilm膜封好主平板,倒置贮放于4℃,直至获得杂交反应的结果。
(6) 裂解细菌,按本段下面所述方法,使释放的DNA结合于纤维素滤膜。
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