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组织原位杂交(Tissue in situ hybridization），即原位杂交组织化学技术和原位杂交细胞化学技术

原位杂交技术的基本原理

利用核酸分子单链之间有互补的碱基顺序，植物原位杂交，通过碱基对之间非共价键的形成，出现稳定的双链区，形成杂交的双链。

1.两条核苷酸单链片段，在适宜的条件下，染色体荧光原位杂交，通过氢键结合，荧光原位杂交，形成DNA-DNA、DNA一RNA或RNA一RNA双键分子

2.应用带有标记的（有性同位素，如3H、35S、32P，荧光素、生物素、等非性物质)DNA或RNA片段作为核酸探针，与组织切片或细胞内待测核酸(RNA或DNA）片段进行杂交

3.用自显影等方法予以显示，在光镜或电镜下观察目的mRNA或DNA的存在与定位

用原位杂交术，可在原位研究细胞合成某种多肽或蛋白质的基因表达。

此方法有很高的敏感性和特异性，原位杂交，可进一步从分子水来探讨细胞的功能表达及其调节机制。已成为当今细胞生物学、分子生物学研究的重要手段。

原位杂交技术是在一定的温度和离子浓度下，使具有特异序列的单链探针通过碱基互补规则与组织细胞内待测的核酸复性结合而使得组织细胞中的特异性核酸得到定位，并通过探针上所标记的检测系统将其在核酸的原有位置上显示出来。经特定标记的核苷酸链为探针，可与组织切片、细胞或染色体标本中的待检DNA片段或mRNA进行杂交，然后显示标记物，从而分析待检核酸的分布和含量。利用此项技术可研究各种基因在染色体上的定位，编码某种蛋白质的mRNA在胞质中的表达。

基因组原位杂交技术基因组原位杂交(Genome in situ hybridization，GISH)技术是20世纪80年代末发展起来的一种原位杂交技术。它主要是利用物种之间DNA同源性的差异，用另一物种的基因组DNA以适当的浓度作封阻，在靶染色体上进行原位杂交。GISH技术初应用于动物方面的研究(Pinkel et al.，1986)，在植物上早应用于小麦和栽培种的鉴定(余舜武等 2001；王文奎等 2000)。

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