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植物原位杂交在遗传育种方面的应用主要包括:
异源染色质及多种染色体畸变检测:通过远缘杂交把有用遗传物质基因的异源染色质渐渗到植物中。如带有几种抗病基因的黑麦1R染色体已被整合到许多高产的小麦品种中。原位杂交技术则是鉴定外源染色体(质)的有效手段。
基因组印记研究:基因组印记是指一个基因的两条染色体上的DNA序列存在差异。通过植物原位杂交技术,可以检测到基因组印记的存在和分布,从而帮助确定基因组的进化、遗传和功能特征。
原位杂交杂交液
(一)杂交液内除含一定浓度的标记探针外,染色体荧光原位杂交,还含有较高浓度的盐类、甲酰胺、硫酸葡聚糖、牛白蛋白及载体DNA或RNA等。
(二)杂交液中含有较高浓度的Na+可使杂交率增加,可以减低探针与组织标本之间的静电结合。
(三)贾酰胺可使杂交温度降低,所以杂交液中加入适量的甲酰胺,可避免因杂交温度过高而引起的组织形态结构的破坏以及标本的脱落。
(四)硫酸葡聚糖能与水结合,植物原位杂交,从而减少杂交液的有效容积,提高探针有效浓度,以达到提高杂交率的目的。
将32 P标记的双链DNA探针于100℃加热5分钟,迅速置于冰浴中。单链探针不必变性。将探针加到杂交袋中杂交过夜。杂交期间,盛滤膜的容器应盖严,以防液体蒸发。
杂交结束后,去除杂交液,原位杂交,立即于室温把滤膜放入大体积(300-500ml)的2×SSC和0.1% SDS溶液中,轻轻振摇5分钟,并将滤膜至少翻转一次。重复洗 一次,同时应避免膜干涸。
68℃用300-500ml 1×SSC和0.1% SDS溶液洗膜两次,每次1-1.5小时。此时已可进行自显影。如背景很高或实验要求严格的洗膜条件,可用300-500ml 0.2×SSC和0.1% SDS的溶液于68℃将滤膜浸泡60分钟。
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