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相关数据库
SUBA:主要聚焦于植物蛋白质的亚细胞定位信息,为研究植物细胞内蛋白质的分布和功能提供了丰富的数据资源。
Cell-PLoc:提供了多种生物蛋白质亚细胞定位的预测和注释信息,涵盖了细菌、真菌、动物和植物等多个物种。
Human Protein Atlas:专注于人类蛋白质的亚细胞定位数据,通过多种实验技术和方法,系统地对人类蛋白质在细胞内的位置进行了标注和展示。
亚细胞定位即指某种生物大分子物质或脂类在细胞内存在的具体位置。蛋白质在细胞质中经过翻译并合成,由蛋白质分选信号引导而被转运到特定的亚细胞结构中以参与细胞的各种生命活动,这一过程称为蛋白质亚细胞定位。蛋白质的功能、代谢以及相互作用等都与其亚细胞定位密切相关,成熟蛋白质必须在特定的亚细胞结构中才能发挥正确稳定的生物学功能,如果定位发生偏差,将对细胞功能甚至生命产生重大影响,因此对蛋白质亚细胞定位的研究具有重要意义。
禾谷菌 CgRab5A 的亚细胞定位研究:刘涵等人利用多片段一步法将 CgRab5A 自身启动子、GFP 片段和 CgRab5A 开放阅读框(ORF)片段到 pKNT 载体上,转化型禾谷菌的原生质体后,通过共聚焦显微镜观察 GFP-CgRab5A 在菌丝和孢子内的定位情况。结果表明,双分子荧光互补技术,GFP-CgRab5A 在菌丝和孢子细胞内均呈点状分布,定位于早期内涵体上。
水稻 OsUF 的亚细胞定位:丁作美等人通过得到水稻 E3 泛素连接酶 — 泛素融合蛋白(OsUF)基因的 cDNA 序列,并利用 Gateway 同源重组体系将 OsUF cDNA 全长重组到融合表达绿色荧光蛋白(GFP)的表达载体上,通过农杆菌介导的烟草瞬时表达系统进行亚细胞定位。结果显示,OsUF 蛋白定位在细胞核。
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